Ассоциация — морское братство, все члены которого с чистой душой стремятся к поиску и сохранению, изучению и популяризации морского природного и культурного наследия России. Она объединяет физические и юридические лица, занятые изучением, сохранением и популяризацией морского культурного и природного наследия.
Среди учредителей Ассоциации: Северный (Арктический) федеральный университет, Институт экологических проблем Севера УрО РАН, Балтийский Федеральный Университет, Музей Мирового океана, Центральный военно-морской музей, национальный парк «Русская Арктика» и др. Ассоциация обеспечивает работы Межведомственной комиссии по морскому наследию Морской коллегии при Правительстве Российской Федерации.
Ассоциация осуществляет свою деятельность в рамках специализированных комиссий. Работа в области сохранения, изучения и популяризации природного наследия координируется Комиссией по природному наследию, морским научным стационарам и особо охраняемым природным территориям (ООПТ).